首当其冲的便是云司令。在宛北只手遮天的他，势力庞大。刚解决掉周少雄，本打算将卢少骅交给警方，却没料到卢少骅在婚礼现场按下炸弹。从卢少骅、K 哥等人毫发无损的细节来看，这炸弹威力有限，大概率只是制造烟雾以便逃脱。可如此关键的人物，后续却没了下文。他究竟是被 K 哥的手下杀害，还是继续在宛北为非作歹，亦或是被警方成功缉拿？诸多疑问萦绕在观众心头，而编剧和导演似乎遗忘了这个角色，未给出任何交代，让观众满心疑惑却无从解答。
再者是 K 哥。作为比云司令段位更高的大毒枭，他有钱有势且胆大包天。按照常理，这样的人物在被绳之以法或遭遇不测时，理应有着惊心动魄的大场面。但剧情却安排他被亲生儿子杀害，如此戏剧性的情节，实在难以服众。他的儿子平日里只知驯马，性格早已被 K 哥驯化。在逃命的紧急关头，突然情绪爆发弑父，这一情节的设置缺乏足够的铺垫与合理性，仿佛是导演为了节省经费，仓促安排，放弃了拍摄本应精彩的警匪大战情节，使得 K 哥的落幕显得潦草又突兀。
吴燕萍的结局同样令人难以接受。这个哑女初次被卢少骅欺骗或许出于无辜，可第二次明知对方是毒贩，还心甘情愿为其生孩子，这一行为实在让人无法共情。后来，她因卢少骅去找马英子，竟在家中半夜吸毒，最终导致流产。这一系列情节的发展，让吴燕萍的人设崩塌，观众看着她的遭遇，只觉困惑与无奈，难以对其产生同情。
杨威与王奇这对角色的结局也差强人意。杨威在剧中似乎没有遭受任何实质性的惩罚，最终老婆孩子热炕头，生活平静。反观林强峰，为了保护他，反而牺牲在毒贩的炸弹之下，这样的对比，让观众难以理解剧情的逻辑。而王奇，在剧中的作用似乎只是唱歌与暗恋，每次出场都依靠滤镜和光影营造氛围感。更离谱的是，在结局时她突然冒出一个新男朋友，丝毫看不出她对林强峰有过多深的感情，其角色的塑造与结局的安排，都显得仓促且不合理。
此外，剧中像花姐、刘青、黄科长、沈萍等角色，他们的最终现状，剧情也未明确说明。一部剧的结局，本应是对所有主要角色命运的总结与交代，让观众有始有终地感受故事的完整。但《扫毒风暴》中这部分角色结局的缺失或不合理，无疑给这部剧留下了遗憾，使得观众在观剧结束后，仍觉意难平，心中充满了对这些角色本应更精彩结局的遐想 。
